Βιοπληροφορικές μελέτες δομής και λειτουργίας μεμβρανικών πρωτεϊνών

Περίληψη

Οι μεμβρανικές πρωτεΐνες επιτελούν µια σειρά από πολύ σημαντικές λειτουργίες, απαραίτητες για τη ζωή του κυττάρου. Τη μεγάλη πλειοψηφία των διαμεμβρανικών πρωτεϊνών, αποτελούν πρωτεΐνες των οποίων τα διαμεμβρανικά τμήματα έχουν τη δομή α-έλικας η οποία αποτελείται κυρίως από υδρόφοβα αμινοξικά κατάλοιπα που διαπερνούν το υδρόφοβο εσωτερικό της λιπιδικής διπλοστιβάδας. Η μεγάλη σπουδαιότητα των διαμεμβρανικών πρωτεϊνών, αλλά και οι εγγενείς δυσκολίες που παρουσιάζονται σε προσπάθειες κρυστάλλωσης τους, καθιστούν απαραίτητη τη δημιουργία υπολογιστικών αλγορίθμων οι οποίοι θα πρέπει να προβλέπουν σχετικά αξιόπιστα και γρήγορα τη δευτεροταγή τους δομή αλλά και τα πιθανά λειτουργικά τους χαρακτηριστικά. Αποφασιστικής σημασίας για τη μελέτη της δομής μιας διαμεμβρανικής πρωτεΐνης είναι η εύρεση της τοπολογίας της στη μεμβράνη, δηλαδή ο αριθμός των διαμεμβρανικών τμημάτων, η θέση τους στην ακολουθία της πρωτεΐνης και ο προσανατολισμός τους σε σχέση με το επίπεδο της μεμβράνης. Στα πλαίσια τη ...
περισσότερα

Περίληψη σε άλλη γλώσσα

Membrane proteins perform a variety of very important biological functions necessary for the survival of the cell. The vast majority of transmembrane proteins are proteins whose transmembrane segments form an alpha-helix composed of mainly hydrophobic residues, spanning the lipid bilayer hydrophobic interior. The importance of transmembrane proteins, as well as the inherent difficulties in crystallizing and obtaining a three-dimensional structure of these proteins, dictates the need for developing computational algorithms and tools that may allow a reliable and fast prediction of their structural and functional features. In order to understand their function we must acquire knowledge about their structure and topology in relation to the membrane. By topology, we refer to the knowledge of the number and the exact localization of transmembrane segments, as well as their orientation with respect to the lipid bilayer. In this study, we developed novel algorithms and computer software, ba ...
περισσότερα

Όλα τα τεκμήρια στο ΕΑΔΔ προστατεύονται από πνευματικά δικαιώματα.

DOI
10.12681/eadd/44234
Διεύθυνση Handle
http://hdl.handle.net/10442/hedi/44234
ND
44234
Εναλλακτικός τίτλος
Bioinformatics studies of structure and function of membrane proteins
Συγγραφέας
Τσαούσης, Γεώργιος του Νικόλαος
Ημερομηνία
2014
Ίδρυμα
Εθνικό και Καποδιστριακό Πανεπιστήμιο Αθηνών (ΕΚΠΑ). Σχολή Θετικών Επιστημών. Τμήμα Βιολογίας. Τομέας Βιολογίας Κυττάρου και Βιοφυσικής
Εξεταστική επιτροπή
Χαμόδρακας Σταύρος
Μπάγκος Παντελεήμων
Προμπονάς Βασίλειος
Βοργιάς Κωνσταντίνος
Ηλιόπουλος Ηλίας
Στραβοπόδης Δημήτριος
Οικονομίδου Βασιλική
Επιστημονικό πεδίο
Φυσικές Επιστήμες
Βιολογία
Λέξεις-κλειδιά
Μεμβρανικές πρωτεϊνες; Προγνωστικοί αλγόριθμοι; Κρυφά μαρκοβιανά μοντέλα; Α-ελικοειδείς διαμεμβρανικές πρωτεΐνες
Χώρα
Ελλάδα
Γλώσσα
Ελληνικά
Άλλα στοιχεία
14, xx, 269 σ., εικ., πιν., σχημ., γραφ.
Ειδικοί όροι χρήσης/διάθεσης
Το έργο παρέχεται υπό τους όρους της δημόσιας άδειας του νομικού προσώπου Creative Commons Corporation:
Στατιστικά χρήσης
ΠΡΟΒΟΛΕΣ
Αφορά στις μοναδικές επισκέψεις της διδακτορικής διατριβής.
Πηγή: Google Analytics.
ΞΕΦΥΛΛΙΣΜΑΤΑ
Αφορά στο άνοιγμα του online αναγνώστη.
Πηγή: Google Analytics.
ΜΕΤΑΦΟΡΤΩΣΕΙΣ
Αφορά στο σύνολο των μεταφορτώσων του αρχείου της διδακτορικής διατριβής.
Πηγή: Εθνικό Αρχείο Διδακτορικών Διατριβών.
ΧΡΗΣΤΕΣ
Αφορά στις μοναδικές επισκέψεις της διδακτορικής διατριβής.
Πηγή: Εθνικό Αρχείο Διδακτορικών Διατριβών.
Σχετικές εγγραφές (με βάση τις επισκέψεις των χρηστών)