Ανάπτυξη οντολογιών για την μελέτη τροπικών ασθενειών

Περίληψη

Δέκα χρόνια μετά την αλληλούχιση του ανθρώπινου γονιδιώματος, παραμένει ζητούμενο ο ακριβής αριθμός και η λειτουργική ανάλυση των ανθρώπινων γονιδίων. Η ανάλυση του ολοένα και μεγαλύτερου όγκου διαθέσιμων δεδομένων με την βοήθεια ηλεκτρονικών υπολογιστών επιτάχυνε την διαδικασία και υπογράμμισε την αναγκαιότητα της βιοπληροφορική στην σύγχρονη βιολογική έρευνα. Ταυτόχρονα ανέδειξε την ανάγκη νέων εργαλείων και τρόπων οργάνωσης των βιολογικών δεδομένων. Η χρήση οντολογιών είναι κομβικό σημείο στην προσπάθεια αυτή. Στο πλαίσιο της παρούσας διατριβής δημιουργήθηκαν οντολογίες για: την περιγραφή της ανατομίας του κουνουπιού, την περιγραφή και τον έλεγχο της ανθεκτικότητας σε εντομοκτόνα που εμφανίζουν πληθυσμοί κουνουπιών και τέλος, για την ελονοσία. Με βάση αυτές τις οντολογίες αναπτύχθηκαν εργαλεία που δίνουν την δυνατότητα προσθήκης επισημειώσεων στις υπάρχουσες βάσεις δεδομένων για τον ιστό στον οποίο εκφράζονται συγκεκριμένα γονίδια, εμπλουτίζοντάς τες. Παράλληλα, καθιστού ...
περισσότερα

Περίληψη σε άλλη γλώσσα

Ten years after the publication of the human genome, the functional analysis of human genes is still at an embryonic stage. The use of computers to analyze the increasing volume of the available data accelerated the process and underlined the necessity of bioinformatics into the modern research in the field of molecular biology. At the same time the need for new tools and new ways to semantically organize the available data it became obvious. The use of ontologies is a major step forward towards this direction. Within the frame of this work new ontologies have been created to describe the gross anatomy of mosquitoes, to facilitate detection and monitoring of insecticide resistance often observed in mosquito populations especially in the areas where spraying is the main measure for vector control and finally to describe malaria. Based on these ontologies new tools have been developed to facilitate gene annotation with anatomical terms. Moreover a new database to detect and m ...

Όλα τα τεκμήρια στο ΕΑΔΔ προστατεύονται από πνευματικά δικαιώματα.