Απομόνωση, χαρακτηρισμός και κρυσταλλική δομή της χαρυβδίνης, μιας νέας πρωτεΐνης, από τον οργανισμό Charybdis maritima. Ανάπτυξη βιοαισθητήρα που βασίζεται σε φωτοσύστημα για την ανίχνευση ζιζανιοκτόνων

Περίληψη

Το πρώτο μέρος της παρούσας εργασίας αναφέρεται στο χαρακτηρισμό μια νέας πρωτεΐνης, που απομονώθηκε από βολβούς του οργανισμού Charybdis maritimα, και ονομάστηκε χαρυβδίνη. Το ενδιαφέρον για το συγκεκριμένο οργανισμό οφείλεται στο γεγονός ότι περιέχει ένα αρκετά μεγάλο αριθμό ενώσεων με σημαντικές φαρμακευτικές ιδιότητες. Η χαρυβδίνη απομονώθηκε σε καθαρή μορφή και παρήχθησαν κρύσταλλοι οι οποίοι και έδωσαν δεδομένα περίθλασης σε διακριτικότητα 1,6A. Τα δεδομένα περίθλασης αναλύθηκαν για τον προσδιορισμό των χαρακτηριστικών της δομή της, ενώ προσδιορίστηκε επίσης η αλληλουχία DNA καθώς και η αμινοξική αλληλουχία. Η σύγκριση της αλληλουχίας αμινοξέων της χαρυβδίνης με αλληλουχίες μεγάλου αριθμού πρωτεϊνών έδειξε ότι η χαρυβδίνη είναι μέλος μια σημαντικής οικογένειας πρωτεϊνών οι οποίες αναστέλλουν μη αντιστρεπτά τη δράση των ριβοσωμάτων (Ribosome Inactivating Proteins - RIP). Η χαρυβδίνη αποτελείται από μια ενιαία πολύπεπτιδική αλυσίδα με μοριακό βάρος περίπου 29 kDa, η οποία (μέσω ενό ...
περισσότερα

Περίληψη σε άλλη γλώσσα

Α. In the present work, we describe the purification, characterization and structural determination of charybdin, a novel 29kDa protein from bulbs of Charybdis maritima agg. Charybdin was characterized by biochemical methods and its structure determined by X-ray crystallography. The DNA sequence, and derived amino acid sequence, revealed a significant homology with various ribosome inactivating proteins (RIPs) Although charybdin inhibited the rabbit reticulocyte translation system, the estimated IC50 value of 24nM indicates that it is not such a strong inhibitor of protein synthesis as other RIPs. Single crystals were grown in the cold room from PEG6000 solutions. Diffraction data collected to 1.6 A resolution led to the protein structure with the Molecular Replacement method. The active site of RIPs, which contains four key amino acid residues, is highly conserved. Although the three of the four key residues are present at the active site of charybdin, the fourth residue, which is an ...
περισσότερα
Πρέπει να είστε εγγεγραμένος χρήστης για έχετε πρόσβαση σε όλες τις υπηρεσίες του ΕΑΔΔ  Είσοδος /Εγγραφή

Όλα τα τεκμήρια στο ΕΑΔΔ προστατεύονται από πνευματικά δικαιώματα.

DOI
10.12681/eadd/16041
Διεύθυνση Handle
http://hdl.handle.net/10442/hedi/16041
Εναλλακτικός τίτλος
Isolation, characterization and crystal structure of charybdin, a new, protein from Charybdis maritima. Production of a biosensor based on photosystem for herbicide detection
Συγγραφέας
Τουλουπάκης, Ελευθέριος Εμμανουήλ
Ημερομηνία
2006
Ίδρυμα
Πανεπιστήμιο Κρήτης. Σχολή Θετικών Επιστημών. Τμήμα Χημείας
Εξεταστική επιτροπή
Γανωτάκης Δημήτριος
Βαρώτσης Κωνσταντίνος
Ορφανόπουλος Μιχαήλ
Τοκατλίδης Κωνσταντίνος
Κοτζαμπάσης Κυριάκος
Τσιώτης Γεώργιος
Χανιωτάκης Νικόλαος
Επιστημονικό πεδίο
Φυσικές Επιστήμες
Χημεία
Λέξεις-κλειδιά
Πρωτείνες αναστολείς ριβοσωμάτων; Δομές; Αλληλουχίες; Ζιζανιοκτόνα; Αμπερομετρία; Βιοαισθητήρες
Χώρα
Ελλάδα
Γλώσσα
Ελληνικά
Άλλα στοιχεία
187 σ., εικ.