Ανίχνευση των μεταλλάξεων της κυστικής ινώδους νόσου στον Ελληνικό πληθυσμό

Abstract

Η ΚΥΣΤΙΚΗ ΙΝΩΔΗΣ ΝΟΣΟΣ ΕΙΝΑΙ ΤΟ ΣΥΧΝΟΤΕΡΟ ΝΟΣΗΜΑ ΤΗΣ ΛΕΥΚΗΣ ΦΥΛΗΣ ΚΑΙ ΚΛΗΡΟΝΟΜΕΙΤΑΙ ΜΕ ΥΠΟΛΕΙΠΟΜΕΝΟ ΣΩΜΑΤΙΚΟ ΧΑΡΑΚΤΗΡΑ.Η ΝΟΣΟΣ ΟΦΕΙΛΕΤΑΙ ΣΤΙΣ ΜΕΤΑΛΛΑΞΕΙΣ ΤΟΥ ΓΟΝΙΔΙΟΥ ΠΟΥ ΕΛΕΓΧΕΙ ΤΗ ΣΥΝΘΕΣΗ ΜΙΑΣ ΜΕΜΒΡΑΝΙΚΗΣ ΠΡΩΤΕΙΝΗΣ ΠΟΥ ΚΑΛΕΙΤΑΙ ''ΡΥΘΜΙΣΤΗΣ ΔΙΑΜΕΜΒΡΑΝΙΚΗΣ ΔΙΑΚΙΝΗΣΗΣ ΙΟΝΤΩΝ'' ΚΑΙ ΛΕΙΤΟΥΡΓΕΙ ΣΑΝ CAMP-ΡΥΘΜΙΖΟΜΕΝΟ ΚΑΝΑΛΙ ΧΛΩΡΙΟΥ.ΓΙΑ ΤΟΝ ΚΑΘΟΡΙΣΜΟ ΤΗΣ ΜΟΡΙΑΚΗΣ ΔΙΑΤΑΡΑΧΗΣΤΗΣ ΝΟΣΟΥ ΣΤΗ ΧΩΡΑ ΜΑΣ ΕΛΕΓΞΑΜΕ 250 ΑΣΘΕΝΕΙΣ ΜΕ ΤΗ ΜΕΘΟΔΟ ΤΗΣ ΚΑΘΕΤΗΣ ΗΛΕΚΤΡΟΦΟΡΗΣΗΣ ΣΕ ΠΗΚΤΩΜΑ ΠΟΛΥΑΚΡΥΛΑΜΙΔΗΣ ΜΕ ΚΛΙΣΗ ΑΠΟΔΙΑΤΑΚΤΙΚΟΥ(DGGE) ΚΑΙ ΑΝΑΛΥΣΗ ΤΗΣ ΑΛΛΗΛΟΥΧΙΑΣ ΤΟΥ DNA (SEQUENCING).ΜΕΤΑ ΑΠΟ ΤΟΝ ΕΛΕΓΧΟ ΚΑΙ ΤΩΝ 27 ΕΞΟΝΙΩΝ ΑΝΙΧΝΕΥΘΗΚΑΝ 54 ΜΕΤΑΛΛΑΞΕΙΣ ΠΟΥ ΚΑΛΥΠΤΟΥΝ ΤΟ 89.8% ΤΩΝ ΠΑΘΟΛΟΓΙΚΩΝ ΧΡΩΜΟΣΩΜΑΤΩΝ.Σ'ΑΥΤΕΣ ΠΕΡΙΛΑΜΒΑΝΟΝΤΑΙ ΚΑΙ 11 ΜΕΤΑΛΛΑΞΕΙΣ ΠΟΥ ΠΕΡΙΓΡΑΦΟΝΤΑΙ ΓΙΑ ΠΡΩΤΗ ΦΟΡΑ ΔΙΕΘΝΩΣ (A46D,296+1G>C,D110E,Y247X,1497 DELGG,E822X,2751+2T>A,2752-26A>G,3153DELT,3272-4A>G, D1445N).H ΔF508 ΑΝΙΧΝΕΥΘΗΚΕ ΣΤΟ 53.6% ΤΩΝ ΠΑΘΟΛΟΓΙΚΩΝ ΧΡΩΜΟΣΩΜΑΤΩΝ, ΕΝΩ ΜΟΝΟ ΑΛΛΕΣ 11 ΜΕΤΑΛΛΑΞΕΙΣ ΑΝΙΧΝΕΥΘΗΚΑΝ ΣΕ ΠΟΣΟΣΤΟ >=1%, ΣΥΜΠΕΡΙΛΑΜΒΑΝΟΜΕΝΗΣ ΚΑΙ ΤΗΣ ΝΕΑΣ ΜΕΤΑΛΛΑΞΗΣ Ε822Χ(1.8%).ΤΟ 10.2% ΤΩΝ ΜΕΤΑΛΛΑΞΕΩΝ ΠΑΡΕΜΕΙΝΕ ΑΔΙΕΥΚΡΙΝΙΣΤΟ.ΕΛΕΓΧΟΣ 7 ΕΞΟΝΙΩΝ ΤΟΥ ΓΟΝΙΔΙΟΥ (10,11,4,21,13,146,176) ΜΕ ΤΗΝ ΤΕΧΝΙΚΗ ΤΟΥ DGGE ΚΑΛΥΠΤΕΙ ΤΟ 80.41% ΤΩΝ ΜΕΤΑΛΛΑΞΕΩΝ.

CYSTIC FIBROSIS IS THE MOST COMMON FATAL AUTOSOMAL RECESSIVE DISORDER IN CAUCASIANS , WITH CARRIER FREQUENCY OF APPROXIMATELY 1:20 TO 1:25. THE DISEASE IS CAUSED BY MUTATIONS IN THE GENE CONTROLLING THE SYNTHESIS OF A MEMBRANE PROTEIN CALLED CFTR:CYSTIC FIBROSIS TRANSMEMBRANE CONDUCTANE REGULATOR,WHICH IS PREDICTED TO FUNCTION AS A CAMP-REGULATED CHLORIDE CHANNEL. TO COMPLETELY CHARACTERIZE THE SPECTRUM OF MUTATIONS IN THE CFTR GENE IN GREEK CF PATIENTS, WE SCREENED 500 GREEK CF CHROMOSOMES BY DENATURING GRADIENT GEL ELECTROPHORESIS FOLLOWED BY DIRECT SEQUENCING. THE WHOLE CODINE SEQUENCING OF EXONS 1-24 AND THEIR INTRONEXONS BOUNDARIES HAVE BEEN ANALYSED .WE IDENTIFIED 54 MUTATIONS ACCOUNTING FOR 89.8% OF CF CHROMOSOMES, INCLUDING 11 NOVEL ΜUTATIONS(A46P,296+1G>C,D110E,Y247X,1497DELGG,E822X,2751+21>A,2752-26A>G,3153DELT,3272+4A>G,D1445N).ΔF508 MUTATIONS ACCOUNTS FOR 53.6% OF GREEK CF CHROMOSOMES AND ANOTHER 11 MUTATIONS HAVE FREQUENCIES >=1%, INCLUDING THE NOVEL MUTATION E822X(1.8%) SCREENING 7 EXONS OF THE CFTR GENE(10,4,11,21,13,146,176) BY DGGE, 80.4% OF CF CHROMOSOMES CAN BE DETECTED.