Αλληλούχηση επόμενης γενιάς (next generation sequencing) ως εργαστηριακό διαγνωστικό εργαλείο σε σπάνια γενετικά νοσήματα και αξιολόγηση των ευρημάτων με βιοπληροφορικές και εργαστηριακές μεθόδους

Περίληψη

Μέχρι σήμερα έχουν περιγραφεί περίπου 6000 με 7000 διαφορετικές σπάνιες ασθένειες με ύποπτη γενετική αιτιολογία και έχουν ταυτοποιηθεί σχεδόν 4500 σχετιζόμενα γονίδια. Η έλευση των τεχνολογιών προσδιορισμού αλληλουχίας επόμενης γενιάς (NGS) έχει φέρει επανάσταση στη γονιδιωματική έρευνα και διάγνωση, προσδίδοντας σημαντική πρόοδο στον εντοπισμό αιτιοπαθογόνων γενετικών παραλλαγών. Η παρούσα διδακτορική διατριβή παρουσιάζει την εφαρμογή του NGS ως εργαστηριακό διαγνωστικό εργαλείο σε σπάνιες γενετικές ασθένειες. Συμπεριλήφθηκαν 500 ασθενείς, οι οποίοι παραπέμφθηκαν για γενετική ανάλυση ασθενειών άγνωστης αιτιολογίας και εφαρμόστηκε μια βασισμένη στο φαινότυπο στρατηγική ανάλυσης, στα δεδομένα αλληλούχησης εξονίων. Στο πλαίσιο της βελτιστοποίησης της διαγνωστικής απόδοσης του ES και της ελαχιστοποίησης του κόστους και του χρόνου μέχρι την οριστική διάγνωση, εφαρμόσθηκε αλληλούχηση εξονίων μόνο του εξεταζόμενου ατόμου και εν συνεχεία στοχευμένος έλεγχος μελών οικογενείας για τη διερεύνηση ...
περισσότερα

Περίληψη σε άλλη γλώσσα

About 6000 to 7000 different rare disorders with suspected genetic etiologies have been described and almost 4500 causative gene(s) have been identified. The advent of next-generation sequencing (NGS) technologies has revolutionized genomic research and diagnostics, representing a major advance in the identification of pathogenic genetic variations. This thesis presents the application of NGS as laboratory diagnostic tool in rare genetic disorders, where 500 patients were referred for genetic analysis of disorders with unknown, but likely genetic, etiology. A phenotype-driven proband-only exome sequencing (ES) strategy was applied for the investigation of rare disorders, in the context of optimizing ES diagnostic yield and minimizing costs and time to definitive diagnosis. Overall molecular diagnostic yield reached 50% in the proband cohort and characterized 279 pathogenic variants in 248 cases, 125 of which were novel and 154 known contributing information to the international communi ...
περισσότερα

Όλα τα τεκμήρια στο ΕΑΔΔ προστατεύονται από πνευματικά δικαιώματα.

DOI
10.12681/eadd/51465
Διεύθυνση Handle
http://hdl.handle.net/10442/hedi/51465
ND
51465
Εναλλακτικός τίτλος
Next Generation Sequencing as laboratory diagnostic tool in rare genetic diseases and evaluation of the findings with others bioinformatics and technical methods
Συγγραφέας
Μαρινάκης, Νικόλαος του Μιχαήλ
Ημερομηνία
2022
Ίδρυμα
Εθνικό και Καποδιστριακό Πανεπιστήμιο Αθηνών (ΕΚΠΑ). Σχολή Επιστημών Υγείας. Τμήμα Ιατρικής. Εργαστήριο Ιατρικής Γενετικής
Εξεταστική επιτροπή
Συνοδινού Ιωάννα-Ραχήλ
Τζέτη Μαρία
Πόνς-Ροντρίγκεθ Μαρία-Ροζέ
Κανακά-Gantenbein Χριστίνα
Καττάμης Αντώνιος
Σπούλου Βασιλική
Μακρυθανάσης Περικλής
Επιστημονικό πεδίο
Ιατρική και Επιστήμες ΥγείαςΒασική Ιατρική ➨ Γενετική ανθρώπου
Λέξεις-κλειδιά
Σπάνια γενετικά νοσήματα; Αλληλούχηση επόμενης γενιάς; Ερμηνεία γενετικών αποτελεσμάτων
Χώρα
Ελλάδα
Γλώσσα
Ελληνικά
Άλλα στοιχεία
εικ., πιν., σχημ., γραφ.
Στατιστικά χρήσης
ΠΡΟΒΟΛΕΣ
Αφορά στις μοναδικές επισκέψεις της διδακτορικής διατριβής.
Πηγή: Google Analytics.
ΞΕΦΥΛΛΙΣΜΑΤΑ
Αφορά στο άνοιγμα του online αναγνώστη.
Πηγή: Google Analytics.
ΜΕΤΑΦΟΡΤΩΣΕΙΣ
Αφορά στο σύνολο των μεταφορτώσων του αρχείου της διδακτορικής διατριβής.
Πηγή: Εθνικό Αρχείο Διδακτορικών Διατριβών.
ΧΡΗΣΤΕΣ
Αφορά στις μοναδικές επισκέψεις της διδακτορικής διατριβής.
Πηγή: Εθνικό Αρχείο Διδακτορικών Διατριβών.
Σχετικές εγγραφές (με βάση τις επισκέψεις των χρηστών)