Πρότυπα αερομεταφερόμενης γύρης κατά μήκος μιας υψομετρικής διαβάθμισης στις Ιταλικές Άλπεις: εφαρμογή αλληλούχισης νέας γενιάς σε περιβαλλοντικό DNA και κλασικών μεθόδων ταυτοποίησης γύρης

Περίληψη

Σκοπός της διατριβής ήταν (α) η ανάπτυξη κατάλληλης μεθοδολογίας ανίχνευσης και ταυτοποίησης γύρης σε περιβαλλοντικά δείγματα με εφαρμογή μοριακών προσεγγίσεων και (β) η εφαρμογή αυτής της μεθοδολογίας για την ανίχνευση χωρικών και χρονικών προτύπων της αερομεταφερόμενης γύρης σε μια υψομετρική διαβάθμιση και τη διερεύνηση της δυνατότητας να χρησιμοποιηθεί η προσέγγιση metabarcoding για την βιοπαρακολούθηση των αλλαγών της βλάστησης. Αναπτύχθηκε κατάλληλο πρωτόκολλο επεξεργασίας δειγμάτων διαφορετικού τύπου και πολυπλοκότητας προς απομόνωση του DNA γύρης, χρησιμοποιήθηκαν οι μέθοδοι αλληλούχισης Sanger και νέας γενιάς (NGS) και συγκρίθηκαν τα αποτελέσματα που προέκυψαν με τα προερχόμενα από την κλασική μέθοδο ταυτοποίησης γύρης με μικροσκόπιο. Το πρωτόκολλο αυτό σε συνδυασμό με τη μέθοδο NGS εφαρμόστηκε σε περιβαλλοντικά δείγματα από έξι οικοτόπους των Ιταλικών Άλπεων (εθνικό πάρκο Paneveggio–Pale di San Martino) ενώ κατασκευάστηκε μια τοπική βάση δεδομένων με αλληλουχίες DNA για τα ta ...
περισσότερα

Περίληψη σε άλλη γλώσσα

The aim of the study was (i) the development of an efficient method for pollen taxonomic identification from complex environmental samples by use of molecular approaches, and (ii) the application of this method for the detection of spatio-temporal patterns of airborne pollen in a mountainous area and the evaluation of the potential of metabarcoding to be used for monitoring vegetation changes. We developed an optimal protocol for processing samples of different type and complexity for DNA extraction, further applied Sanger and next generation sequencing (NGS), and compared results to those taken by classical microscopy. We applied this protocol in combination with NGS to environmental samples from six habitats along the altitudinal gradient of the Italian Alps (National Park of Paneveggio–Pale di San Martino). Providing high resolution taxonomic results, metabarcoding can be used for biodiversity assessments and floral surveys and for monitoring vegetation changes, particularly those e ...
περισσότερα

Όλα τα τεκμήρια στο ΕΑΔΔ προστατεύονται από πνευματικά δικαιώματα.

Διεύθυνση Handle
http://hdl.handle.net/10442/hedi/43848
ND
43848
Εναλλακτικός τίτλος
Airborne pollen patterns along an altitudinal gradient of the Italian Alps: combination of classical pollen identification methods and next generation sequencing on environmental DNA
Συγγραφέας
Λεοντίδου, Κλεοπάτρα του Χρήστος
Ημερομηνία
2018
Ίδρυμα
Αριστοτέλειο Πανεπιστήμιο Θεσσαλονίκης (ΑΠΘ). Σχολή Θετικών Επιστημών. Τμήμα Βιολογίας. Τομέας Οικολογίας
Εξεταστική επιτροπή
Βώκου Δέσποινα
Vernesi Cristiano
Casiraghi Maurizio
Καλλιμάνης Αθανάσιος
Τσιριπίδης Ιωάννης
Δρούζας Ανδρέας
Δάμιαλης Αθανάσιος
Επιστημονικό πεδίο
Φυσικές ΕπιστήμεςΒιολογία
Λέξεις-κλειδιά
Αεροβιολογία; Αλληλούχιση νέας γενιάς; Μοριακή Οικολογία; Περιβαλλοντικά δείγματα; Βιοποικιλότητα
Χώρα
Ελλάδα
Γλώσσα
Αγγλικά
Άλλα στοιχεία
145 σ., εικ., πιν., σχημ., γραφ.
Στατιστικά χρήσης
ΠΡΟΒΟΛΕΣ
Αφορά στις μοναδικές επισκέψεις της διδακτορικής διατριβής.
Πηγή: Google Analytics.
ΞΕΦΥΛΛΙΣΜΑΤΑ
Αφορά στο άνοιγμα του online αναγνώστη.
Πηγή: Google Analytics.
ΜΕΤΑΦΟΡΤΩΣΕΙΣ
Αφορά στο σύνολο των μεταφορτώσων του αρχείου της διδακτορικής διατριβής.
Πηγή: Εθνικό Αρχείο Διδακτορικών Διατριβών.
ΧΡΗΣΤΕΣ
Αφορά στις μοναδικές επισκέψεις της διδακτορικής διατριβής.
Πηγή: Εθνικό Αρχείο Διδακτορικών Διατριβών.