ΣΥΝΘΕΣΗ ΚΑΙ ΑΝΑΛΥΣΗ ΤΗΣ ΔΙΑΜΟΡΦΩΣΗΣ ΠΕΠΤΙΔΙΩΝ ΑΝΑΛΟΓΩΝ ΤΟΥ ΚΕΝΤΡΙΚΟΥ ΤΜΗΜΑΤΟΣ ΤΗΣ ΛΟΥΛΙΜΠΕΡΙΝΗΣ: ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΤΗΣ Β-ΣΤΡΟΦΗΣ ΜΕ ΣΥΜΠΛΟΚΑ ΜΕ...

Abstract

IN ORDER TO VISUALIZE SPECIFIC SIDE CHAIN-SIDE CHAIN INTERACTIONS IN PEPTIDES VIA CHARGE TRANSFER COMPLEXES BETWEEN TRP AND NVA(NIC+) WITH THE AIM OF FORMULATING A RATHER SIMPLE WAY TO EVALUATE THE PROBABILITY OF A B-TURN CONFORMATION THREE MODEL TETRAPEPTIDES WERE PREPARED BY THE SOLID PHASE TECHNIQUE: AC-TRP- TYR-X-NVA(NIC+)-NH2.CL- WHERE X STANDS FOR D-ALA, GLY, OR L-ALA, AND REFLECTS A GRADUAL DECREASE OF FOLDING. THESE MOLECULES WERE ANALYSED BY UV-VIS AND 1H-NMR SPECTROSCOPIES. ALL THE THREE ANALOGUES SHOWED A CHARACTERISTIC CHARGE-TRANSFER BAND AS A SHOULDER IN THE LONG WAVE LENGTH REGION OF THE UV-VIS SPECTRA. THE DIFFERENCES IN THE INTENSITY AT 380 NM REVEAL AN INCREASED SIDE CHAIN- SIDE CHAININTERACTION IN THE ORDER OF L-ALA<GLY<D- ALA FOR X. ON THE OTHER HAND, ON THE BASE OF THE NMR DATA IT CAN BE CONCLUDED THAT AN OPEN REVERSE B-TURN OCCURS, OFTHE TYPE II WHEN X=D-ALA AND OF THE TYPE I WHEN X=L-ALA. THE TYPE OF THE TURN IS FURTHER SUPPORTED BY SELECTIVE NOE MEASUREMENTS. IN CONCLUSION SUCH COMPLEXES CAN BE USED AS SELECTIVE CONFORMATIONAL PROBES TO RECOGNIZE SPECIFIC INTERACTIONS AND PROVIDE INFORMATION ABOUT THE STATISTICAL OCCURENCE OF THE FOLDED CONFORMER.

ΠΡΟΚΕΙΜΕΝΟΥ ΝΑ ΜΠΟΡΟΥΝ ΝΑ ΔΙΕΡΕΥΝΩΝΤΑΙ ΕΞΕΙΔΙΚΕΥΜΕΝΕΣ ΑΛΛΗΛΕΠΙΔΡΑΣΕΙΣ ΜΕΤΑΞΥ ΠΑΡΑΠΛΕΥΡΩΝ ΑΛΥΣΙΔΩΝ ΣΕ ΠΕΠΤΙΔΙΑ ΔΙΑ ΜΕΣΟΥ ΣΥΜΠΛΟΚΩΝ ΜΕΤΑΦΟΡΑΣ ΦΟΡΤΙΟΥ ΜΕΤΑΞΥ TRPΚΑΙ NVA(NIC+) ΜΕ ΣΚΟΠΟ ΝΑ ΚΑΘΙΕΡΩΘΕΙ ΕΝΑΣ ΜΑΛΛΟΝ ΑΠΛΟΣ ΤΡΟΠΟΣ ΓΙΑ ΤΗΝ ΕΚΤΙΜΗΣΗΤΗΣ ΠΙΘΑΝΟΤΗΤΑΣ ΤΗΣ ΔΙΑΜΟΡΦΩΣΗΣ Β-ΣΤΡΟΦΗΣ ΠΑΡΑΣΚΕΥΑΣΘΗΚΑΝ ΤΡΙΑ ΠΡΟΤΥΠΑ ΤΕΤΡΑΠΕΠΤΙΔΙΑ ΜΕ ΤΗΝ ΤΕΧΝΙΚΗ ΤΗΣ ΣΤΕΡΕΑΣ ΦΑΣΗΣ: AC-TRP- TYR-X-NVA(NIC+)-NH2.CL- ΟΠΟΥ ΤΟ Χ ΕΙΝΑΙ D-ALA, GLY, 'Η L-ALA ΚΑΙ ΑΝΤΙΚΑΤΟΠΤΡΙΖΕΙ ΜΙΑ ΒΑΘΜΙΑΙΑ ΜΕΙΩΣΗ ΤΗΣ ΔΙΠΛΩΣΗΣ. ΑΥΤΑ ΤΑ ΜΟΡΙΑ ΑΝΑΛΥΘΗΚΑΝ ΜΕ ΦΑΣΜΑΤΟΣΚΟΠΙΕΣ ΥΠΕΡΙΩΔΟΥΣ-ΟΡΑΤΟΥ ΚΑΙ ΠΡΩΤΟΝΙΑΚΟΥ ΜΑΓΝΗΤΙΚΟΥ ΣΥΝΤΟΝΙΣΜΟΥ. ΚΑΙ ΤΑ ΤΡΙΑ ΑΝΑΛΟΓΑ ΠΑΡΟΥΣΙΑΣΑΝ ΜΙΑ ΧΑΡΑΚΤΗΡΙΣΤΙΚΗ ΖΩΝΗ ΑΠΟΡΡΟΦΗΣΗΣ ΜΕΤΑΦΟΡΑΣ ΦΟΡΤΙΟΥ ΣΤΗΝ ΜΑΚΡΟΥ ΜΗΚΟΥΣ ΚΥΜΑΤΟΣ ΠΕΡΙΟΧΗ ΤΩΝ ΦΑΣΜΑΤΩΝ ΥΠΕΡΙΩΔΟΥΣ-ΟΡΑΤΟΥ. ΟΙ ΔΙΑΦΟΡΕΣ ΣΤΗΝ ΕΝΤΑΣΗ ΣΤΑ 380 ΝΜ ΑΠΟΚΑΛΥΠΤΟΥΝ ΜΙΑ ΑΥΞΑΝΟΜΕΝΗ ΑΛΛΗΛΕΠΙΔΡΑΣΗ ΜΕΤΑΞΥ ΤΩΝ ΠΑΡΑΠΛΕΥΡΩΝ ΑΛΥΣΙΔΩΝ ΚΑΤΑ ΤΗ ΣΕΙΡΑ L- ALA<GLY<D-ALA ΓΙΑ ΤΟ Χ. ΕΞ'ΑΛΛΟΥ ΜΕ ΒΑΣΗ ΤΑ NMR ΔΕΔΟΜΕΝΑ ΜΠΟΡΕΙ ΝΑ ΕΞΑΧΘΕΙ ΤΟ ΣΥΜΠΕΡΑΣΜΑΟΤΙ ΣΥΜΒΑΙΝΕΙ ΜΙΑ ΑΝΟΙΚΤΗ ΑΝΤΙΣΤΡΟΦΗ Β- ΣΤΡΟΦΗ ΤΟΥ ΤΥΠΟΥ ΙΙ ΟΤΑΝ X=D-ALA ΚΑΙ ΤΟΥ ΤΥΠΟΥ Ι ΟΤΑΝ X=L-ALA. Ο ΤΥΠΟΣ ΤΗΣ ΣΤΡΟΦΗΣ ΥΠΟΣΤΗΡΙΖΕΤΑΙ ΠΕΡΑΙΤΕΡΩ ΜΕ ΕΚΛΕΚΤΙΚΑ ΝΟΕ ΠΕΙΡΑΜΑΤΑ. ΩΣ ΣΥΜΠΕΡΑΣΜΑ ΠΡΟΚΥΠΤΕΙ ΟΤΙ ΤΕΤΟΙΑ ΣΥΜΠΛΟΚΑ ΜΠΟΡΟΥΝ ΝΑ ΧΡΗΣΙΜΟΠΟΙΗΘΟΥΝ ΩΣ ΕΚΛΕΚΤΙΚΟΙ ΜΑΡΤΥΡΕΣ ΤΗΣ ΔΙΑΜΟΡΦΩΣΗΣ ΠΡΟΚΕΙΜΕΝΟΥ ΝΑ ΑΝΑΓΝΩΡΙΣΘΟΥΝ ΕΞΕΙΔΙΚΕΥΜΕΝΕΣ ΑΛΛΗΛΕΠΙΔΡΑΣΕΙΣ ΚΑΙ ΝΑ ΑΠΟΚΤΗΘΟΥΝ ΠΛΗΡΟΦΟΡΙΕΣ ΓΙΑ ΤΗΝ ΣΤΑΤΙΣΤΙΚΗ ΤΟΥ ΔΙΠΛΩΜΕΝΟΥ ΔΙΑΜΟΡΦΩΜΕΡΟΥΣ.