Μικροσυστοιχίες DNA για την καταγραφή και μελέτη της γονιδιακής έκφρασης: μέθοδοι ανάλυσης εικόνας και ανάλυση γονιδιακής έκφρασης για την κατανόηση του μηχανισμού δράσης μεταγραφικών παραγόντων και ιστοειδικής έκφρασης

Περίληψη

Ο σκοπός της εργασίας που περιγράφεται σε αυτή τη διατριβή απέβλεπαν στην ανάπτυξη της τεχνολογίας των μικροσυστοιχιών και εφαρμογή νέων μεθόδων και εργαλείων αφενός και αφεταίρου στην εφαρμογή της στην απάντηση βασικών βιολογικών ερωτημάτων. Αρχικά, παρουσιάζεται η ανάπτυξη τριών μεθοδολογιών για την ανάλυση εικόνας από μικροσυστοιχίες που αυξάνουν την επαναληψιμότητα των παραγόμενων αποτελεσμάτων, καθώς και την αύξηση της δυναμικής διακύμανσής τους. Στην επόμενη ενότητα, με τη χρήση μικροσυστοιχιών αναλύεται η in vivo συμμετοχή του βασικού μεταγραφικού συμπλόκου TFIID στη μεταγραφή ηπατοκυττάρων σε διαφορετικά αναπτυξιακά στάδια. Τα αποτελέσματα αυτής της ανάλυσης έδειξαν ότι το TFIID είναι απαραίτητο μόνο κατά τη μεταγραφική έναρξη και όχι στα επόμενα στάδια της μεταγραφής. Επίσης αποκάλυψε για πρώτη φορά τη συμμετοχή του συμπλόκου στη μεταγραφική σίγηση γονιδίων που εκφράζονταν σε προηγούμενα στάδια. Κατόπιν, η εστίαση των ερευνών αλλάζει από τη βασική μεταγραφική μηχανή στους μετα ...
περισσότερα

Περίληψη σε άλλη γλώσσα

The aim of the work described in this thesis is the development of microarray technology using new methods and tools, on the one hand and, on the other, its employment to address basic scientific questions. The starting point is the development of three methodologies for microarray image analysis which increase the reproducibility of data, as well as increase the dynamic range of the measurements. Then, we employ microarray analysis to focus on the in vivo requirement of gene expression for the general transcription complex TFIID in hepatocytes in different developmental stages. The results of this work showed that TFIID is needed during the initial steps of the assembly of the pre-initiation complex, while it is dispensable for the following steps. It also revealed for the first time the involvement of the complex in silencing of previously expressed genes. After that, we shift the focus of the study from global to gene-specific transcription factors. We constructed a boutique microar ...
περισσότερα
Πρέπει να είστε εγγεγραμένος χρήστης για έχετε πρόσβαση σε όλες τις υπηρεσίες του ΕΑΔΔ  Είσοδος /Εγγραφή

Όλα τα τεκμήρια στο ΕΑΔΔ προστατεύονται από πνευματικά δικαιώματα.

DOI
10.12681/eadd/17258
Διεύθυνση Handle
http://hdl.handle.net/10442/hedi/17258
Εναλλακτικός τίτλος
DNA microarrays for monitoring and analysis of gene expession
Συγγραφέας
Μαργαρίτης, Αθανάσιος Βύρων
Ημερομηνία
2008
Ίδρυμα
Πανεπιστήμιο Κρήτης. Σχολή Θετικών και Τεχνολογικών Επιστημών. Τμήμα Βιολογίας
Εξεταστική επιτροπή
Πανόπουλος Νικόλαος
Καφετζόπουλος Δημήτρης
Ζερβάκης Μιχάλης
Παπαματθαιάκης Σήφης
Καρδάσης Δημήτρης
Αλεξανδράκη Δέσποινα
Δελιδάκης Χρήστος
Επιστημονικό πεδίο
Φυσικές Επιστήμες
Βιολογικές Επιστήμες
Λέξεις-κλειδιά
Μικροσυστοιχίες; Γονιδιακή έκφραση; Μεταγραφή; Ανάλυση εικόνων; Μεταγραφικοί παράγοντες; Συνενεργοποιητές; Λάδανο; Ιστοειδική έκφραση
Χώρα
Ελλάδα
Γλώσσα
Ελληνικά
Άλλα στοιχεία
222 σ., εικ.