Ανασυνδυασμένα στελέχη πολιοϊών - θέσεις γενετικού ανασυνδυασμού

Περίληψη

Στη παρούσα διατριβή αναλύονται ανασυνδυασμένα στελέχη πολιοϊών τα οποία απομονώθηκαν από κλινικά και περιβαλλοντικά δείγματα. Αρχικά αναζητήθηκαν οι πιθανές θέσεις ανασυνδυασμών στο γένωμα των πολιοϊών καλύπτοντας την γενωμική περιοχή από τη 2C έως τη 3D με σκοπό τον εντοπισμό όλων των πιθανών σημείων ανασυνδυασμού. Πέντε κλινικά στελέχη προερχόμενα από υγιείς εμβολιασμένους και ασθενείς με VAPP εξετάσθηκαν για τον εντοπισμό θέσεων ανασυνδυασμού. Κατόπιν ανάλυσης RT-PCR,RFLP και αλληλούχισης , σε τρεις γενωμικές περιοχές (5’UTR, 2C και 3C-D) τα πέντε δείγματα εμφάνισαν θέσεις ανασυνδυασμού. Τα ανασυνδυασμένα δείγματα στη συνέχεια αλληλουχήθηκαν από τη 2C έως τη 3’UTR. Τα στελέχη ΕΡ6 και ΕΡ12 παρουσίασαν τον τύπο ανασυνδυασμού S2/S1 στη 3D γενωμική περιοχή, ενώ τα στελέχη ΕΡ16 και ΕΡ23 τους τύπους S3/S2 και S3/S1 αντίστοιχα στη 2C περιοχή. Το στέλεχος ΕΡ9 βρέθηκε ανασυνδυασμένο στη 3Α περιοχή ως S2/S1, γενωμική περιοχή όπου οι ανασυνδυασμοί σπανίζουν. Άξιο λόγου είναι το γεγον ...
περισσότερα

Περίληψη σε άλλη γλώσσα

This thesis describes the analysis of recombinant poliovirus strains obtained from clinical and environmental samples. Five polio/Sabin recombinant strains isolated from healthy vaccinees or from VAPP patients after OPV administration, were analysed. RT-PCR, followed by Restriction Fragment Length Polymorphism (RFLP) screening analysis was applied in four distant genomic regions (5' UTR, VP1, 2C and 3C-3D) in order to detect any putative recombinant. The detected recombinants were sequenced from 2C to the end of the genome (3' UTR) and the exact recombination sites were determined with computational analysis. Two of the recombinants were found in the 2C genomic region, isolates EP16:S3/S2, EP23:S3/S1, two in 3D genomic region isolates EP6:S2/S1, EP12:S2/S1 and one in 3A genomic region isolate EP9:S2/Sl. Point mutations were found in strains EP3, EP6, EP9 and EP12. Five more clinical Sabin intertypic recombinant strains were investigated. Strains EPA, EPB and EPC were found to be bi-re ...
περισσότερα
Πρέπει να είστε εγγεγραμένος χρήστης για έχετε πρόσβαση σε όλες τις υπηρεσίες του ΕΑΔΔ  Είσοδος /Εγγραφή

Όλα τα τεκμήρια στο ΕΑΔΔ προστατεύονται από πνευματικά δικαιώματα.

DOI
10.12681/eadd/17217
Διεύθυνση Handle
http://hdl.handle.net/10442/hedi/17217
Εναλλακτικός τίτλος
Recombinant poliovirus strains - sites of genetic recombination
Συγγραφέας
Παξιμάδη, Ελένη Δημήτριος
Ημερομηνία
2009
Ίδρυμα
Πανεπιστήμιο Θεσσαλίας. Σχολή Επιστημών Υγείας. Τμήμα Βιοχημείας και Βιοτεχνολογίας
Εξεταστική επιτροπή
Μαρκουλάτος Παναγιώτης
Μαμούρης Ζήσης
Σταθόπουλος Κωνσταντίνος
Κατής Νικόλαος
Κουρέτας Δημήτριος
Κομιώτης Δημήτριος
Ζίφα Αμαλία
Επιστημονικό πεδίο
Ιατρική & Επιστήμες Υγείας
Βασική Ιατρική
Λέξεις-κλειδιά
Πολιοϊοί; Ανασυνδιασμός; Εμβόλια; Στελέχη; Κλινικό περιβάλλον; Θέσεις; Μεταλλάξεις
Χώρα
Ελλάδα
Γλώσσα
Ελληνικά
Άλλα στοιχεία
188 σ., εικ.