Νέες τεχνολογίες μοριακών γενετικών αναλύσεων στη διάγνωση και στην πρόγνωση του καρκίνου με έμφαση στο μαστό και στο παχύ έντερο

Abstract

Breast cancer is the second most common type of cancer in the female population, while ovarian cancer ranks sixth. The disease is inherited in an autosomal dominant manner. BRCA1 & BRCA2 gene mutations account for 5-10% of clinical cases of breast and/or ovarian cancer. With the evaluation made regarding the mutations in the Greek population and the detection of pathogenic mutations in genes other than BRCA1 and BRCA2 we conclude that the mutation gene panel examination is very important. the most useful tool for the detection of as many mutations as possible, but also for the detection of large deletions or duplications, is WGS, where the analysis of CNVs can also be carried out. This additional information may help in the early diagnosis of breast cancer and subsequently in its better prognosis. The aim of the present study , regarding breast cancer, was to evaluate the techniques and their results so as to use the most suitable ones for immediate diagnosis and better prognosis. In the colon, the change in the methylation pattern is observed in the early stages of cancer and is directly linked to the onset of the disease. Early detection of polyps reduces the risk of metastases through their subsequent removal, while the diagnosis of colon cancer at an early asymptomatic stage ensures a greater chance of successful treatment. Early detection of polyps reduces the risk of metastases through their subsequent removal, while the diagnosis of colon cancer at an early asymptomatic stage ensures a greater chance of successful treatment. Therefore, it was deemed necessary to develop a non-invasive screening method for suspicious cases. The method is based on the evaluation of the epigenetic marker of methylation in epithelial cells that have been excreted with the feces. Specifically, the methylation levels of three genomic regions of DNA extracted from epithelial cells are determined. Feces appear to be the sample of choice for non-invasive colon cancer screening as DNA (ctDNA) is derived directly from tumor tissue and/or precancerous lesions. The method was evaluated and it is very important that it seems to be able to detect even very small lesions (polyps). In conclusion, it is a method that can contribute to the early diagnosis and therefore to the good prognosis of colon cancer.

Ο καρκίνος του μαστού αποτελεί το δεύτερο σε συχνότητα τύπο καρκίνου στο γυναικείο πληθυσμό, ενώ ο καρκίνος των ωοθηκών καταλαμβάνει την έκτη θέση . Η νόσος κληρονομείται με αυτοσωμικό επικρατή τρόπο. Οι μεταλλάξεις των γονιδίων BRCA1 & BRCA2 ερμηνεύουν το 5-10% των κλινικών περιστατικών καρκίνου μαστού ή/και ωοθηκών. Με την αξιολόγηση που έγινε σχετικά με τις μεταλλάξεις στον Ελληνικό πληθυσμό και την ανίχνευση παθογόνων μεταλλάξεων και σε άλλα γονίδια εκτός από το BRCA1 και BRCA2 συμπεραίνουμε ότι είναι πολύ σημαντική η εξέταση πάνελ γονιδίου μεταλλάξεων. Το χρησιμότερο εργαλείο βέβαια και για την ανίχνευση όσο το δυνατό περιςσότερων μεταλλάξεων αλλά και για την ανίχνευση μεγάλων απαλειφών ή διπλασιασμών είναι το WGS όπου μπορεί να πραγματοποιηθεί και η ανάλυση των CNVs . Οι επιπλέον αυτές πληροφορίες μπορεί να βοηθήσουν στην έγκαιρη διάγνωση του καρκίνου του μαστού και επομένος στην καλύτερη πρόγνωση αυτού. Ο στόχος της παρούσας μελέτης, σχετικά με τον καρκίνο του μαστού, ήταν η αξιολόγηση των τεχνικών και των αποτελεσμάτων τους και εφαρμογή των καταλληλότερων για άμεση διάγνωση και καλύτερη πρόγνωση. Στο παχύ έντερο η αλλαγή του προτύπου μεθυλίωσης παρατηρείται στα πρώιμα στάδια του καρκίνου και συνδέεται άμεσα με την έναρξη της νόσου. Η έγκαιρη ανίχνευση των πολυπόδων μειώνει τον κίνδυνο εξαλλαγής μέσω της επακόλουθης αφαίρεσής τους, ενώ η διάγνωση του καρκίνου του παχέος εντέρου σε πρώιμο ασυμπτωματικό στάδιο διασφαλίζει μεγαλύτερη πιθανότητα επιτυχούς θεραπευτικής αντιμετώπισης. Η έγκαιρη ανίχνευση των πολυπόδων μειώνει τον κίνδυνο εξαλλαγής μέσω της επακόλουθης αφαίρεσής τους, ενώ η διάγνωση του καρκίνου του παχέος εντέρου σε πρώιμο ασυμπτωματικό στάδιο διασφαλίζει μεγαλύτερη πιθανότητα επιτυχούς θεραπευτικής αντιμετώπισης. Επομένως κρίθηκε αναγκαία η ανάπτυξη μιας μεθόδου μη επεμβατικού τεστ διαλογής ύποπτων περιστατικών (screening). Η μέθοδος βασίζεται στην αξιολόγηση του επιγενετικού δείκτη της μεθυλίωσης σε επιθηλιακά κύτταρα τα οποία έχουν αποβληθεί με τα κόπρανα. Συγκεκριμένα προσδιορίζονται τα επίπεδα μεθυλίωσης τριών γενωμικών περιοχών του DNA που εξάγεται από τα επιθηλιακά κύτταρα. Τα κόπρανα φαίνεται ότι αποτελούν το δείγμα επιλογής για τον μη επεμβατικό προσυμπτωματικό έλεγχο καρκίνου του παχέος εντέρου καθώς το DNA (ctDNA) προέρχεται απευθείας από τον ιστό του του όγκου ή/και προκαρκινικών αλλοιώσεων. Η μέθοδος αξιολογήθηκε και είναι πολύ σημαντικό το γεγονώς ότι φαίνεται πως μπορεί να ανιχνεύει ακόμα και τις πολύ μικρές αλλοιώσεις (πολύποδες). Φυσικά χρειάζεται περαιτέρω αξιολόγηση με μεγαύτερο αριθμό δειγμάτων. Συμπερασματικά, είναι μία μέθοδος που μπορεί να συνεισφέρει στην πρώιμη διάγνωση και συνεπώς και στην καλή πρόγνωση του καρκίνου του παχέος εντέρου.