Using variable selection methods in network meta-analysis

Abstract

The current thesis aims to address two common challenges encountered in network meta-analysis (NMA), the evaluation of consistency and the handling of multi-component interventions. Consistency assessment is vital as the validity of the NMA findings is primary affected by the satisfaction of this assumption. Significant discrepancies between direct and indirect evidence may lead to biased NMA estimates. In particular, a brief overview of (N)MA and the standard method used to evaluate consistency is presented. Additionally, a novel method for identifying inconsistencies is proposed that evaluates network consistency both globally and locally. This was accomplished by integrating the Stochastic Search Variable Selection method into the NMA framework and treating inconsistency factors as variables in a generalized linear model. Historical evidence and differences between direct and indirect evidence that are considered of practical significant, can be also incorporated into the inconsistency detection process. The performance of the proposed method was evaluated in two published networks under various scenarios. Furthermore, to facilitate the implementation of the method, the user-friendly R-package ssifs was developed and published on CRAN. Concerning the handling of multi-component interventions, novel ways of visualizing NMA results are proposed that allow for the easy identification of the most efficacious components, exploration of the network’s geometry and examination of the components’ behaviour. To implement these tools, the user-friendly R-package viscomp was developed and published on CRAN. Lastly, some concluding remarks and suggestions for future research are provided.

Η συγκεκριμένη διατριβή στοχεύει στην αντιμετώπιση δύο συχνών προβλημάτων που συναντώνται στην μετα-ανάλυση δικτύου, την αξιολόγηση της υπόθεσης της συνέπειας και τον χειρισμό παρεμβάσεων πολλών συνιστωσών. Η αξιολόγηση της υπόθεσης της συνέπειας είναι κομβικής σημασίας, καθώς η αξιοπιστία των αποτελεσμάτων της μετα-ανάλυσης δικτύου εξαρτάται σε μεγάλο βαθμό από αυτή την υπόθεση. Μεγάλες διαφορές μεταξύ άμεσης και έμμεσης πληροφορίας μπορεί να οδηγήσει σε μεροληπτικά αποτελέσματα. Στην διατριβή αρχικά γίνεται μια ανασκόπηση της μετα-ανάλυσης και της μετα-ανάλυσης δικτύου, καθώς και των συχνών μεθόδων που χρησιμοποιούνται για την αξιολόγηση της υπόθεσης της συνέπειας. Έπειτα παρουσιάζεται μια καινοτόμα μέθοδος για την εύρεση ασυνεπειών στο δίκτυο, η οποία έχει την δυνατότητα να ανιχνεύει τοπικά που υπάρχουν ασυνέπειες και να αξιολογεί γενικά το δίκτυο αν πληρεί την υπόθεση της συνέπειας. Αυτό επιτυγχάνεται αντιμετωπίζοντας το μοντέλο της μετα-ανάλυσης δικτύου ως ένα μοντέλο παλινδρόμησης και χρησιμοποιώντας την μέθοδο στοχαστικής αναζήτησης επιλογής μεταβλητών. Σημαντικά πλεονεκτήματα που προσφέρει η προτεινόμενη μέθοδος είναι η δυνατότητα εύρεσης ασυνεπειών χρησιμοποιώντας εξωτερική πληροφορία, και η εύρεση ασυνεπειών βάσει διαφορών που θεωρούνται πρακτικά σημαντικές. Η προτεινόμενη μέθοδος αξιολογήθηκε σε δύο δημοσιευμένα δίκτυα μετα-ανάλυσης υπό διάφορα σενάρια. Επιπρόσθετα, για την εύκολη χρήση της μεθόδου, κατασκευάστηκε το στατιστικό πακέτο ssifs, το οποίο είναι δημοσιευμένο στο CRAN. Αναφορικά με τον χειρισμό παρεμβάσεων πολλών συνιστωσών, προτείνονται νέοι τρόποι οπτικοποίησης των αποτελεσμάτων της μετα-ανάλυσης δικτύου, οι οποίοι επιτρέπουν την εύκολη εύρεση των πιο αποτελεσματικών συνιστωσών, την διερεύνηση του δικτύου και της συμπεριφοράς των συνιστωσών. Για την εύκολη χρήση των προτεινόμενων εργαλείων οπτικοποίησης των αποτελεσμάτων της μετα-ανάλυσης δικτύου, κατασκευάστηκε το στατιστικό πακέτο viscomp, το οποίο είναι δημοσιευμένο στο CRAN. Τέλος παρατίθενται ορισμένες καταληκτικές παρατηρήσεις και προτάσεις για μελλοντική έρευνα.