Contemporary methods of estimation of genetic parameters in broiler chicken populations

Abstract

Πραγματικά και προσομοιωμένα δεδομένα που ακολουθούσαν κανονική και διωνυμική κατανομή αναλύθηκαν χρησιμοποιώντας τη μέθοδο της υπό περιορισμό μέγιστης πιθανοφάνειας καθώς και δύο μεθόδους Bayes (MCMC και INLA). Τα αποτελέσματα της εργασίας δηλώνουν την χρησιμότητα της εφαρμογής των MCMC στη διερεύνηση συνδιακυμάνσεων μεταξύ τυχαίων επιδράσεων. Η μέθοδος INLA φαίνεται να αποτελεί μία εναλλακτική μέθοδο Bayes γρήγορη και χρήσιμη για ανάλυση δεδομένων που ακολουθούν κανονική κατανομή. Για την επιλογή του καταλληλότερου στατιστικού προτύπου ανάλυσης μία σειρά κριτηρίων έχει προταθεί. Εκτός από τα κριτήρια Akaike και BIC, στη συγκεκρίμενη μελέτη εφαρμόστηκε και το cAIC το οποίο λαμβάνει πιο αποτελεσματικά υπόψιν τους δραστικούς βαθμούς ελευθερίας και όπως προέκυψε από τις αναλύσεις είναι δυνατό να προτείνει διαφορετικά πρότυπο. Εξετάσθηκε η συνεισφορά των γενετικών επιδράσεων στο φαινόμενο του φυλετικού διμορφισμού του βάρους κρεοπαραγών ορνιθίων, χρησιμοποιώντας διμεταβλητά πρότυπα ανάλυσης αλλά και δευτερογενείς ιδιότητες που λάμβαναν υπόψη τη διαφορά και το λόγο των σωματικών βαρών αρσενικών και θηλυκών ατόμων. Για το σκοπό αυτό, χρησιμοποιήθηκε ένας μεγάλος αριθμός δεδομένων, αποτελούμενος από 203,323 ατομικές αποδόσεις σωματικών βαρών κρεοπαραγωγών ορνιθίων. Το καλύτερο πρότυπο περιελάμβανε προσθετικές γενετικές, μητρικές γενετικές και μητρικές περιβαλλοντικές επιδράσεις καθώς και τη συνδιακύμανση μεταξύ προσθετικών και μητρικών γενετικών επιδράσεων. Ο συντελεστής κληρονομικότητας δεν παρουσίασε διαφορές μεταξύ αρσενικών και θηλυκών (0.28 vs. 0.29). Μόνο ο συντελεστής συσχέτισης μεταξύ προσθετικών και μητρικών γενετικών επιδράσεων διέφερε ανάμεσα στα φύλα (-0.72 vs. -0.56 για αρσενικά και θηλυκά βάρη, αντίστοιχα), υποδεικύοντας έναν πιο έντονο ανταγωνισμό μεταξύ προσθετικών και μητρικών γενετικών επιδράσεων για τα αρσενικά. Τέλος, χρησιμοποιήθηκαν επιπλέον 35,595 αποδόσεις βαρών κρεοπαραγωγών ορνιθίων στις 35 ημέρες υπό δυσμενείς μικροβιακά συνθήκες για τη διερεύνηση της ύπαρξης αλληλεπίδρασης γονοτύπου περιβάλλοντος. Τα αποτελέσματα της μελέτης έδειξαν την ύπαρξη χαμηλού συντελεστή προσθετικής γενετικής συσχέτισης μεταξύ των δύο περιβαλλόντων, κυμαινόμενου μεταξύ 0,28 και 0,45 ανάλογα το πρότυπο, υποδηλώνοντας την ύπαρξη ισχυρής αλληλεπίδρασης γονοτύπου περιβάλλοντος για τη συγκεκριμένη ιδιότητα στον υπό εξέταση πληθυσμό.