Μέθοδοι βιοπληροφορικής και μοντέλα υπολογιστικής βιολογίας

Περίληψη

Η παρούσα διατριβή αφορά την ανάπτυξη μεθοδολογίας για τη δημιουργία μοντέλων βασισμένων σε οντολογίες, με σκοπό τη δομημένη αναπαράσταση της βιολογικής γνώσης και την κατηγοριοποίηση αυτής ως ένα σύνολο εννοιών, σχέσεων και ιδιοτήτων. Στόχος του προτεινόμενου μοντέλου είναι η αυτοματοποιημένη παροχή διάγνωσης κυρίως για ασθένειες των οποίων η κλινική αντιμετώπισή τους είναι συμπτωματική. Ως μελέτη περίπτωσης, το προτεινόμενο μοντέλο εφαρμόστηκε για την αυτοματοποιημένη διάγνωση και αποτελεσματική διαχείριση της νόσου του Πάρκινσον, η οποία αποτελεί τη δεύτερη σε συχνότητα νευροεκφυλιστική νόσο του νευρικού συστήματος. Η αναπαράσταση και επεξεργασία των βιολογικών δεδομένων πραγματοποιήθηκε με τη χρήση οντολογιών και υλοποιήθηκε με τη βοήθεια του υπολογιστικού εργαλείου Protégé.Τα τρία ερευνητικά βιολογικά προβλήματα που προέκυψαν κατά τη διαδικασία ανάπτυξης του μοντέλου αφορούν γονιδιακές αλληλεπιδράσεις. Συγκεκριμένα, στην πρώτη μελέτη περίπτωσης παρουσιάζεται ένα νέο μοντέλο αναπαρ ...
περισσότερα

Περίληψη σε άλλη γλώσσα

Innovations in high-throughput genomic and proteomic technologies, such as ChIP-Seq, have enabled the collection of large amounts of data in order to simultaneously measure dependencies and regulations among genes on a genome-wide scale. Understanding the interactions between regulatory factors and their target genes in such regulatory networks and encoding the knowledge into Gene Regulatory Networks (GRNs) has the potential of providing an insight into the complex biological processes taking place in cells. Consequently, formal mathematical, statistical methods and computational techniques for modeling and simulation of GRNs become indispensable. The present dissertation represents new efficient combinatorial and stochastic models concerning the RNA-Protein Interaction (RIP) problem and aspects of mitochondrial dynamics. Preserving mitochondrial function is essential for standard wild-type aging. As mitochondrial dynamics have been implicated in the pathogenesis of several neurodegene ...
περισσότερα
Πρέπει να είστε εγγεγραμένος χρήστης για έχετε πρόσβαση σε όλες τις υπηρεσίες του ΕΑΔΔ  Είσοδος /Εγγραφή

Όλα τα τεκμήρια στο ΕΑΔΔ προστατεύονται από πνευματικά δικαιώματα.

Διεύθυνση Handle
http://hdl.handle.net/10442/hedi/36912
Εναλλακτικός τίτλος
Bioinformatics techniques and computational biology models
Συγγραφέας
Ψύχα, Μαρία Ματθαίος
Ημερομηνία
2016
Ίδρυμα
Ιόνιο Πανεπιστήμιο. Τμήμα Πληροφορικής
Εξεταστική επιτροπή
Βλάμος Παναγιώτης
Χρυσικόπουλος Βασίλειος
Σιούτας Σπυρίδων
Μαρία Χατζηνικολάου
Βασίλειος Παπαδόπουλος
Ηλίας Κοτσιρέας
Χρήστος Δουληγέρης
Επιστημονικό πεδίο
Φυσικές Επιστήμες
Επιστήμες Ηλεκτρονικών Υπολογιστών & Πληροφορικής
Βιολογικές Επιστήμες
Λέξεις-κλειδιά
Εργαλεία βιοπληροφορικής; Οντολογίες; Νευρολογικές διαταραχές; Μοντελοποίηση νευρωνικών μηχανισμών; Μοντέλα Υπολογιστικής Βιολογίας
Χώρα
Ελλάδα
Γλώσσα
Αγγλικά
Άλλα στοιχεία
235 σ., πιν., σχημ., ευρ.